Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI1P19237 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNI1P19237 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI1P19237 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI1P19237 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms