Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN8P19075 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN8P19075 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN8P19075 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN8P19075 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN8P19075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms