Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RargP18911 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RargP18911 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RargP18911 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RargP18911 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RargP18911 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RargP18911 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RargP18911 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RargP18911 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RargP18911 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RargP18911 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RargP18911 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RargP18911 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RargP18911 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RargP18911 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RargP18911 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RargP18911 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RargP18911 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RargP18911 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RargP18911 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RargP18911 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RargP18911 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RargP18911 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RargP18911 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RargP18911 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RargP18911 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RargP18911 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RargP18911 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RargP18911 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RargP18911 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RargP18911 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RargP18911 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RargP18911 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RargP18911 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RargP18911 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RargP18911 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RargP18911 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RargP18911 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RargP18911 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RargP18911 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RargP18911 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RargP18911 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RargP18911 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RargP18911 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RargP18911 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RargP18911 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RargP18911 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RargP18911 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RargP18911 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RargP18911 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RargP18911 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RargP18911 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RargP18911 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RargP18911 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RargP18911 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RargP18911 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RargP18911 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RargP18911 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RargP18911 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RargP18911 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RargP18911 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RargP18911 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RargP18911 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RargP18911 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RargP18911 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RargP18911 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RargP18911 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RargP18911 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RargP18911 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RargP18911 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RargP18911 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RargP18911 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RargP18911 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RargP18911 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RargP18911 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RargP18911 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms