Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF4P18848 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF4P18848 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF4P18848 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF4P18848 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF4P18848 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF4P18848 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF4P18848 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF4P18848 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF4P18848 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF4P18848 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF4P18848 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF4P18848 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF4P18848 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF4P18848 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF4P18848 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF4P18848 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF4P18848 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF4P18848 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF4P18848 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF4P18848 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF4P18848 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF4P18848 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF4P18848 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF4P18848 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF4P18848 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF4P18848 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF4P18848 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF4P18848 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF4P18848 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF4P18848 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF4P18848 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF4P18848 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF4P18848 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF4P18848 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF4P18848 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF4P18848 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF4P18848 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF4P18848 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATF4P18848 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATF4P18848 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATF4P18848 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATF4P18848 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATF4P18848 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATF4P18848 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATF4P18848 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATF4P18848 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATF4P18848 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATF4P18848 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATF4P18848 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATF4P18848 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATF4P18848 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATF4P18848 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF4P18848 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms