Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATF3P18847 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATF3P18847 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF3P18847 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF3P18847 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF3P18847 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF3P18847 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF3P18847 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF3P18847 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF3P18847 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF3P18847 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF3P18847 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF3P18847 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF3P18847 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF3P18847 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF3P18847 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATF3P18847 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATF3P18847 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF3P18847 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF3P18847 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF3P18847 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF3P18847 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF3P18847 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATF3P18847 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATF3P18847 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATF3P18847 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF3P18847 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF3P18847 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF3P18847 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF3P18847 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF3P18847 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATF3P18847 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATF3P18847 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF3P18847 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF3P18847 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF3P18847 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF3P18847 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF3P18847 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF3P18847 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ATF3P18847 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ATF3P18847 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATF3P18847 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATF3P18847 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATF3P18847 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATF3P18847 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATF3P18847 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATF3P18847 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATF3P18847 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATF3P18847 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATF3P18847 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF3P18847 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATF3P18847 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ATF3P18847 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATF3P18847 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATF3P18847 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATF3P18847 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATF3P18847 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATF3P18847 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATF3P18847 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATF3P18847 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATF3P18847 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATF3P18847 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF3P18847 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms