Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFEP18615 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFEP18615 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFEP18615 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFEP18615 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFEP18615 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFEP18615 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFEP18615 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFEP18615 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFEP18615 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFEP18615 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFEP18615 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFEP18615 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFEP18615 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFEP18615 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFEP18615 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFEP18615 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFEP18615 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFEP18615 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFEP18615 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFEP18615 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFEP18615 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFEP18615 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFEP18615 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFEP18615 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NELFEP18615 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFEP18615 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFEP18615 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFEP18615 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NELFEP18615 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFEP18615 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NELFEP18615 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NELFEP18615 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NELFEP18615 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFEP18615 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NELFEP18615 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NELFEP18615 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NELFEP18615 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NELFEP18615 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFEP18615 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFEP18615 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NELFEP18615 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFEP18615 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFEP18615 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFEP18615 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFEP18615 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NELFEP18615 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms