Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP1P17987 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP1P17987 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP1P17987 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP1P17987 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP1P17987 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP1P17987 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP1P17987 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP1P17987 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP1P17987 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP1P17987 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP1P17987 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP1P17987 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP1P17987 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP1P17987 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCP1P17987 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCP1P17987 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP1P17987 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP1P17987 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP1P17987 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP1P17987 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP1P17987 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP1P17987 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP1P17987 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP1P17987 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP1P17987 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP1P17987 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP1P17987 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP1P17987 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP1P17987 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP1P17987 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP1P17987 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP1P17987 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP1P17987 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP1P17987 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP1P17987 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP1P17987 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP1P17987 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP1P17987 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP1P17987 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP1P17987 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP1P17987 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP1P17987 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP1P17987 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP1P17987 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP1P17987 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP1P17987 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP1P17987 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCP1P17987 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCP1P17987 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCP1P17987 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCP1P17987 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCP1P17987 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCP1P17987 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCP1P17987 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCP1P17987 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCP1P17987 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCP1P17987 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCP1P17987 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCP1P17987 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TCP1P17987 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCP1P17987 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCP1P17987 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms