Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DESP17661 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DESP17661 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DESP17661 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DESP17661 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DESP17661 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DESP17661 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DESP17661 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DESP17661 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DESP17661 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DESP17661 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DESP17661 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DESP17661 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DESP17661 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DESP17661 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DESP17661 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DESP17661 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DESP17661 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DESP17661 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DESP17661 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DESP17661 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DESP17661 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DESP17661 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DESP17661 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DESP17661 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DESP17661 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DESP17661 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DESP17661 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DESP17661 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DESP17661 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DESP17661 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DESP17661 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DESP17661 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DESP17661 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DESP17661 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DESP17661 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DESP17661 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DESP17661 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DESP17661 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DESP17661 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DESP17661 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DESP17661 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DESP17661 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DESP17661 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DESP17661 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DESP17661 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DESP17661 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DESP17661 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DESP17661 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DESP17661 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DESP17661 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DESP17661 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DESP17661 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DESP17661 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DESP17661 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DESP17661 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DESP17661 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DESP17661 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DESP17661 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DESP17661 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms