Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB6P17509 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB6P17509 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB6P17509 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms