Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptbp1P17225 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptbp1P17225 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptbp1P17225 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms