Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou4f1P17208 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou4f1P17208 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou4f1P17208 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou4f1P17208 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou4f1P17208 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou4f1P17208 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms