Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmga1P17095 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmga1P17095 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmga1P17095 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmga1P17095 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmga1P17095 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms