Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZKSCAN1P17029 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZKSCAN1P17029 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZKSCAN1P17029 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZKSCAN1P17029 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZKSCAN1P17029 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZKSCAN1P17029 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
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