Protein–RNA interactions for Protein: P16118

PFKFB1, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB1P16118 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKFB1P16118 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB1P16118 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PFKFB1P16118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKFB1P16118 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKFB1P16118 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKFB1P16118 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PFKFB1P16118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKFB1P16118 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms