Protein–RNA interactions for Protein: P15806

Tcf3, Transcription factor E2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf3P15806 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf3P15806 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcf3P15806 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcf3P15806 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf3P15806 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf3P15806 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcf3P15806 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms