Protein–RNA interactions for Protein: P15559

NQO1, NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NQO1P15559 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NQO1P15559 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NQO1P15559 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NQO1P15559 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NQO1P15559 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NQO1P15559 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NQO1P15559 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NQO1P15559 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NQO1P15559 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NQO1P15559 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NQO1P15559 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NQO1P15559 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NQO1P15559 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NQO1P15559 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NQO1P15559 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NQO1P15559 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NQO1P15559 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NQO1P15559 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NQO1P15559 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NQO1P15559 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NQO1P15559 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NQO1P15559 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NQO1P15559 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NQO1P15559 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NQO1P15559 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NQO1P15559 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NQO1P15559 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NQO1P15559 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NQO1P15559 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NQO1P15559 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NQO1P15559 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NQO1P15559 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NQO1P15559 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NQO1P15559 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NQO1P15559 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NQO1P15559 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NQO1P15559 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NQO1P15559 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NQO1P15559 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NQO1P15559 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NQO1P15559 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NQO1P15559 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NQO1P15559 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NQO1P15559 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NQO1P15559 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NQO1P15559 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NQO1P15559 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NQO1P15559 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms