Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30aP15533 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim30aP15533 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30aP15533 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30aP15533 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms