Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme1P15532 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme1P15532 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme1P15532 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme1P15532 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme1P15532 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme1P15532 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme1P15532 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme1P15532 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms