Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhoP15409 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhoP15409 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhoP15409 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhoP15409 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhoP15409 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhoP15409 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhoP15409 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhoP15409 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhoP15409 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhoP15409 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhoP15409 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhoP15409 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhoP15409 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RhoP15409 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhoP15409 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhoP15409 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhoP15409 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhoP15409 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhoP15409 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhoP15409 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhoP15409 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhoP15409 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhoP15409 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhoP15409 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhoP15409 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhoP15409 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhoP15409 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhoP15409 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhoP15409 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhoP15409 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhoP15409 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhoP15409 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhoP15409 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RhoP15409 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RhoP15409 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RhoP15409 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RhoP15409 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhoP15409 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhoP15409 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhoP15409 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhoP15409 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhoP15409 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhoP15409 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhoP15409 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhoP15409 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhoP15409 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhoP15409 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhoP15409 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhoP15409 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhoP15409 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhoP15409 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhoP15409 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhoP15409 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhoP15409 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhoP15409 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoP15409 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoP15409 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoP15409 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoP15409 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhoP15409 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhoP15409 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoP15409 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoP15409 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoP15409 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhoP15409 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RhoP15409 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RhoP15409 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoP15409 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoP15409 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoP15409 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoP15409 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhoP15409 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RhoP15409 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhoP15409 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhoP15409 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhoP15409 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoP15409 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhoP15409 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoP15409 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoP15409 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoP15409 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoP15409 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhoP15409 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhoP15409 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhoP15409 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhoP15409 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhoP15409 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhoP15409 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoP15409 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoP15409 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoP15409 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhoP15409 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms