Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb1P13372 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb1P13372 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms