Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4P13236 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4P13236 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4P13236 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4P13236 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4P13236 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4P13236 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4P13236 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4P13236 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4P13236 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4P13236 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4P13236 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4P13236 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4P13236 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4P13236 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4P13236 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL4P13236 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCL4P13236 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCL4P13236 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4P13236 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4P13236 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4P13236 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4P13236 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4P13236 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4P13236 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4P13236 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4P13236 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4P13236 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4P13236 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4P13236 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4P13236 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4P13236 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4P13236 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4P13236 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4P13236 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4P13236 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4P13236 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4P13236 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL4P13236 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL4P13236 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL4P13236 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL4P13236 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL4P13236 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL4P13236 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL4P13236 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL4P13236 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL4P13236 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL4P13236 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCL4P13236 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCL4P13236 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL4P13236 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL4P13236 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL4P13236 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCL4P13236 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL4P13236 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCL4P13236 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL4P13236 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL4P13236 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL4P13236 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCL4P13236 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL4P13236 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL4P13236 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL4P13236 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL4P13236 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCL4P13236 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL4P13236 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL4P13236 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL4P13236 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL4P13236 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL4P13236 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL4P13236 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms