Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COX4I1P13073 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COX4I1P13073 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms