Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP4P12644 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP4P12644 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP4P12644 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP4P12644 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP4P12644 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP4P12644 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP4P12644 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP4P12644 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP4P12644 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP4P12644 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP4P12644 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP4P12644 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP4P12644 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP4P12644 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP4P12644 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP4P12644 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP4P12644 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP4P12644 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP4P12644 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP4P12644 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP4P12644 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP4P12644 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP4P12644 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP4P12644 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP4P12644 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP4P12644 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP4P12644 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP4P12644 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP4P12644 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP4P12644 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP4P12644 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP4P12644 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP4P12644 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP4P12644 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP4P12644 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP4P12644 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP4P12644 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP4P12644 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP4P12644 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP4P12644 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP4P12644 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP4P12644 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP4P12644 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP4P12644 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP4P12644 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP4P12644 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP4P12644 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP4P12644 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP4P12644 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP4P12644 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP4P12644 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP4P12644 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP4P12644 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms