Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt8P11679 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt8P11679 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt8P11679 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt8P11679 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt8P11679 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt8P11679 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms