Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DMDP11532 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DMDP11532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DMDP11532 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DMDP11532 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DMDP11532 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DMDP11532 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DMDP11532 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DMDP11532 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DMDP11532 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DMDP11532 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMDP11532 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMDP11532 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMDP11532 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DMDP11532 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DMDP11532 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMDP11532 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DMDP11532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMDP11532 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMDP11532 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DMDP11532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DMDP11532 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DMDP11532 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DMDP11532 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DMDP11532 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DMDP11532 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DMDP11532 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DMDP11532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DMDP11532 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DMDP11532 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMDP11532 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMDP11532 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DMDP11532 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMDP11532 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMDP11532 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DMDP11532 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMDP11532 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMDP11532 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DMDP11532 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DMDP11532 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DMDP11532 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DMDP11532 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMDP11532 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DMDP11532 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DMDP11532 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DMDP11532 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DMDP11532 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DMDP11532 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DMDP11532 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DMDP11532 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DMDP11532 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DMDP11532 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DMDP11532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DMDP11532 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMDP11532 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMDP11532 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMDP11532 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMDP11532 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms