Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamp1P11438 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamp1P11438 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamp1P11438 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamp1P11438 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lamp1P11438 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms