Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnp2P11378 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnp2P11378 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnp2P11378 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnp2P11378 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnp2P11378 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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