Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTBP11277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBP11277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBP11277 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBP11277 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBP11277 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBP11277 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBP11277 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBP11277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBP11277 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBP11277 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBP11277 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBP11277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBP11277 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBP11277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPTBP11277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBP11277 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBP11277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBP11277 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBP11277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBP11277 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBP11277 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBP11277 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBP11277 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBP11277 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBP11277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBP11277 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBP11277 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBP11277 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBP11277 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBP11277 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBP11277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBP11277 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBP11277 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBP11277 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBP11277 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBP11277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBP11277 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBP11277 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBP11277 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBP11277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBP11277 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBP11277 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBP11277 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBP11277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBP11277 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBP11277 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBP11277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBP11277 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBP11277 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBP11277 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBP11277 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBP11277 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBP11277 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBP11277 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBP11277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms