Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM1P11229 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM1P11229 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRM1P11229 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRM1P11229 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms