Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHGAP10645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHGAP10645 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CHGAP10645 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHGAP10645 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHGAP10645 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHGAP10645 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHGAP10645 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHGAP10645 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHGAP10645 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHGAP10645 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHGAP10645 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHGAP10645 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHGAP10645 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHGAP10645 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHGAP10645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHGAP10645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHGAP10645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHGAP10645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHGAP10645 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHGAP10645 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHGAP10645 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHGAP10645 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHGAP10645 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHGAP10645 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHGAP10645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHGAP10645 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHGAP10645 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CHGAP10645 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CHGAP10645 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHGAP10645 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHGAP10645 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHGAP10645 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHGAP10645 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CHGAP10645 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHGAP10645 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CHGAP10645 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CHGAP10645 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHGAP10645 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHGAP10645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CHGAP10645 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CHGAP10645 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHGAP10645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHGAP10645 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHGAP10645 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHGAP10645 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHGAP10645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHGAP10645 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CHGAP10645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CHGAP10645 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHGAP10645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CHGAP10645 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CHGAP10645 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CHGAP10645 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHGAP10645 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CHGAP10645 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHGAP10645 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CHGAP10645 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHGAP10645 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHGAP10645 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHGAP10645 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHGAP10645 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHGAP10645 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHGAP10645 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHGAP10645 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHGAP10645 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CHGAP10645 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHGAP10645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHGAP10645 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHGAP10645 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CHGAP10645 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHGAP10645 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHGAP10645 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHGAP10645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHGAP10645 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
CHGAP10645 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CHGAP10645 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHGAP10645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHGAP10645 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHGAP10645 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHGAP10645 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHGAP10645 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHGAP10645 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHGAP10645 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHGAP10645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms