Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALM3P0DP25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALM3P0DP25 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALM3P0DP25 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms