Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETSIPP0DME0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETSIPP0DME0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETSIPP0DME0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETSIPP0DME0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETSIPP0DME0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SETSIPP0DME0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms