Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Alkbh1P0CB42 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alkbh1P0CB42 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Alkbh1P0CB42 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alkbh1P0CB42 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms