Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim1P0C8K7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim1P0C8K7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms