Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CT47B1P0C2W7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CT47B1P0C2W7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CT47B1P0C2W7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CT47B1P0C2W7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
CT47B1P0C2W7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CT47B1P0C2W7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms