Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb1P09055 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb1P09055 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb1P09055 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1P09055 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms