Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPAP09012 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPAP09012 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms