Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP2P08253 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP2P08253 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP2P08253 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP2P08253 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP2P08253 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP2P08253 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP2P08253 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP2P08253 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP2P08253 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP2P08253 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP2P08253 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP2P08253 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP2P08253 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP2P08253 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP2P08253 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP2P08253 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP2P08253 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP2P08253 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP2P08253 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP2P08253 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP2P08253 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP2P08253 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP2P08253 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP2P08253 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP2P08253 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP2P08253 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP2P08253 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP2P08253 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP2P08253 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP2P08253 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP2P08253 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP2P08253 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP2P08253 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP2P08253 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP2P08253 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP2P08253 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP2P08253 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP2P08253 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP2P08253 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP2P08253 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP2P08253 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP2P08253 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP2P08253 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP2P08253 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP2P08253 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP2P08253 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP2P08253 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP2P08253 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP2P08253 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP2P08253 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP2P08253 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP2P08253 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP2P08253 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP2P08253 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP2P08253 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP2P08253 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP2P08253 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms