Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI1P08151 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI1P08151 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GLI1P08151 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GLI1P08151 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GLI1P08151 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GLI1P08151 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI1P08151 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI1P08151 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI1P08151 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI1P08151 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI1P08151 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI1P08151 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLI1P08151 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI1P08151 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI1P08151 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLI1P08151 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI1P08151 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI1P08151 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI1P08151 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI1P08151 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GLI1P08151 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI1P08151 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI1P08151 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLI1P08151 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI1P08151 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI1P08151 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI1P08151 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI1P08151 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLI1P08151 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI1P08151 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLI1P08151 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI1P08151 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI1P08151 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI1P08151 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI1P08151 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLI1P08151 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI1P08151 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLI1P08151 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI1P08151 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI1P08151 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI1P08151 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI1P08151 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLI1P08151 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI1P08151 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI1P08151 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI1P08151 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI1P08151 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLI1P08151 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI1P08151 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLI1P08151 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI1P08151 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI1P08151 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI1P08151 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLI1P08151 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLI1P08151 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI1P08151 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI1P08151 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI1P08151 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI1P08151 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI1P08151 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI1P08151 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI1P08151 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI1P08151 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI1P08151 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI1P08151 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI1P08151 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI1P08151 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI1P08151 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI1P08151 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI1P08151 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI1P08151 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI1P08151 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms