Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a2P08122 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a2P08122 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a2P08122 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a2P08122 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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