Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM2P07951 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM2P07951 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM2P07951 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM2P07951 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM2P07951 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM2P07951 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM2P07951 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM2P07951 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM2P07951 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM2P07951 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM2P07951 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM2P07951 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TPM2P07951 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM2P07951 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM2P07951 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM2P07951 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM2P07951 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM2P07951 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM2P07951 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM2P07951 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM2P07951 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM2P07951 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM2P07951 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM2P07951 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM2P07951 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM2P07951 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM2P07951 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM2P07951 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM2P07951 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM2P07951 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM2P07951 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM2P07951 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM2P07951 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM2P07951 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM2P07951 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM2P07951 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM2P07951 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM2P07951 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM2P07951 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TPM2P07951 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM2P07951 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM2P07951 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM2P07951 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM2P07951 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM2P07951 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM2P07951 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM2P07951 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM2P07951 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM2P07951 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM2P07951 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM2P07951 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM2P07951 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms