Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8BP07358 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C8BP07358 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8BP07358 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8BP07358 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8BP07358 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8BP07358 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8BP07358 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8BP07358 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8BP07358 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8BP07358 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8BP07358 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8BP07358 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8BP07358 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8BP07358 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C8BP07358 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8BP07358 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8BP07358 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8BP07358 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8BP07358 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8BP07358 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8BP07358 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8BP07358 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8BP07358 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8BP07358 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8BP07358 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8BP07358 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8BP07358 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8BP07358 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8BP07358 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8BP07358 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8BP07358 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8BP07358 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8BP07358 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8BP07358 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8BP07358 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8BP07358 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8BP07358 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8BP07358 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8BP07358 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8BP07358 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8BP07358 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8BP07358 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8BP07358 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8BP07358 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8BP07358 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8BP07358 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8BP07358 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8BP07358 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8BP07358 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8BP07358 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8BP07358 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8BP07358 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8BP07358 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8BP07358 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8BP07358 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8BP07358 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8BP07358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8BP07358 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8BP07358 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8BP07358 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms