Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa4P06798 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa4P06798 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa4P06798 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa4P06798 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms