Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG5P05408 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG5P05408 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG5P05408 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG5P05408 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG5P05408 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG5P05408 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG5P05408 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG5P05408 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG5P05408 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG5P05408 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG5P05408 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG5P05408 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG5P05408 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG5P05408 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG5P05408 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG5P05408 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG5P05408 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG5P05408 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG5P05408 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG5P05408 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG5P05408 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG5P05408 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG5P05408 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG5P05408 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG5P05408 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCG5P05408 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG5P05408 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG5P05408 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG5P05408 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG5P05408 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG5P05408 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG5P05408 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG5P05408 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG5P05408 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG5P05408 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG5P05408 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG5P05408 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG5P05408 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG5P05408 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG5P05408 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG5P05408 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG5P05408 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG5P05408 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG5P05408 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCG5P05408 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG5P05408 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms