Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYBBP04839 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYBBP04839 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYBBP04839 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYBBP04839 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYBBP04839 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYBBP04839 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYBBP04839 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYBBP04839 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYBBP04839 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYBBP04839 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYBBP04839 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYBBP04839 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYBBP04839 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYBBP04839 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYBBP04839 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYBBP04839 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYBBP04839 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYBBP04839 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYBBP04839 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYBBP04839 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYBBP04839 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYBBP04839 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYBBP04839 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYBBP04839 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYBBP04839 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYBBP04839 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYBBP04839 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYBBP04839 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYBBP04839 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYBBP04839 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYBBP04839 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYBBP04839 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYBBP04839 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYBBP04839 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYBBP04839 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYBBP04839 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYBBP04839 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYBBP04839 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYBBP04839 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYBBP04839 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYBBP04839 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYBBP04839 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYBBP04839 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYBBP04839 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYBBP04839 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYBBP04839 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYBBP04839 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYBBP04839 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYBBP04839 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYBBP04839 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYBBP04839 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYBBP04839 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYBBP04839 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYBBP04839 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYBBP04839 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYBBP04839 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYBBP04839 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYBBP04839 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYBBP04839 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYBBP04839 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYBBP04839 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYBBP04839 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYBBP04839 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYBBP04839 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CYBBP04839 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYBBP04839 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYBBP04839 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYBBP04839 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYBBP04839 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYBBP04839 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYBBP04839 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYBBP04839 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms