Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1P04632 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1P04632 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1P04632 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms