Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QAP02745 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QAP02745 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QAP02745 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QAP02745 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QAP02745 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QAP02745 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QAP02745 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QAP02745 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QAP02745 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QAP02745 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QAP02745 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QAP02745 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QAP02745 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QAP02745 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QAP02745 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QAP02745 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1QAP02745 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QAP02745 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QAP02745 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QAP02745 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QAP02745 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QAP02745 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QAP02745 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QAP02745 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QAP02745 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QAP02745 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QAP02745 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QAP02745 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QAP02745 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QAP02745 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1QAP02745 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1QAP02745 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1QAP02745 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QAP02745 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QAP02745 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QAP02745 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QAP02745 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QAP02745 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QAP02745 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QAP02745 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QAP02745 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QAP02745 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QAP02745 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QAP02745 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QAP02745 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QAP02745 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QAP02745 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QAP02745 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QAP02745 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QAP02745 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QAP02745 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QAP02745 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QAP02745 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QAP02745 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QAP02745 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QAP02745 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QAP02745 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QAP02745 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QAP02745 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QAP02745 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QAP02745 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QAP02745 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QAP02745 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QAP02745 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QAP02745 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QAP02745 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QAP02745 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1QAP02745 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1QAP02745 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms