Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNAP02545 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNAP02545 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMNAP02545 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNAP02545 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNAP02545 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNAP02545 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNAP02545 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNAP02545 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNAP02545 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNAP02545 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNAP02545 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNAP02545 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNAP02545 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNAP02545 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNAP02545 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNAP02545 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNAP02545 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNAP02545 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNAP02545 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNAP02545 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNAP02545 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNAP02545 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNAP02545 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNAP02545 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNAP02545 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNAP02545 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNAP02545 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNAP02545 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNAP02545 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNAP02545 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNAP02545 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNAP02545 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNAP02545 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNAP02545 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNAP02545 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNAP02545 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNAP02545 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNAP02545 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNAP02545 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNAP02545 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNAP02545 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNAP02545 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNAP02545 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNAP02545 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNAP02545 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNAP02545 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNAP02545 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNAP02545 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNAP02545 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNAP02545 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNAP02545 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNAP02545 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNAP02545 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNAP02545 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNAP02545 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNAP02545 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNAP02545 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNAP02545 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNAP02545 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNAP02545 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNAP02545 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNAP02545 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNAP02545 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNAP02545 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNAP02545 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNAP02545 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNAP02545 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNAP02545 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNAP02545 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNAP02545 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNAP02545 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNAP02545 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNAP02545 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNAP02545 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms