Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	ELP4	YPL101W	1371 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YOR012W	YOR012W	414 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	PSP2	YML017W	1782 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	HXT15	YDL245C	1704 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	HXT16	YJR158W	1704 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	YIA6	YIL006W	1122 nt		5.59	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	PRY2	YKR013W	990 nt		5.59	□□□□□ -1.51
VAR1	P02381	PNS1	YOR161C	1620 nt		5.59	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	MKK1	YOR231W	1527 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	ERG24	YNL280C	1317 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	PSA1	YDL055C	1086 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	FPR2	YDR519W	408 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	GTT3	YEL017W	1014 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YGR127W	YGR127W	939 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	OPI1	YHL020C	1215 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	AIM2	YAL049C	741 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	LOT6	YLR011W	576 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	CPT1	YNL130C	1182 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	SMK1	YPR054W	1167 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YPT10	YBR264C	600 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	GDH1	YOR375C	1365 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	MSS51	YLR203C	1311 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YCR041W	YCR041W	333 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	TAD2	YJL035C	753 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	HAC1	YFL031W	717 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	THI4	YGR144W	981 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	MGM101	YJR144W	810 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YBL070C	YBL070C	321 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	SPS1	YDR523C	1473 nt		5.56	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	GRH1	YDR517W	1119 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	SNF4	YGL115W	969 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	EFT2	YDR385W	2529 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	EFT1	YOR133W	2529 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	NUP53	YMR153W	1428 nt		5.55	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	PXL1	YKR090W	2121 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	SOD2	YHR008C	702 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	STS1	YIR011C	960 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YNL200C	YNL200C	741 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	DSC3	YOR223W	879 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	ERV2	YPR037C	591 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	BDS1	YOL164W	1941 nt		5.54	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	MRP1	YDR347W	966 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	CCP1	YKR066C	1086 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	YLR112W	YLR112W	420 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	GLN3	YER040W	2193 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	ALT2	YDR111C	1524 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	OSM1	YJR051W	1506 nt		5.53	□□□□□ -1.52
VAR1	P02381	AFG3	YER017C	2286 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	YKL147C	YKL147C	618 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	AVT4	YNL101W	2142 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	LIP5	YOR196C	1245 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	NUP84	YDL116W	2181 nt		5.52	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	YGL260W	YGL260W	231 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	RIB1	YBL033C	1038 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	FCY2	YER056C	1602 nt		5.51	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	SKI2	YLR398C	3864 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	YIL055C	YIL055C	1884 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	LAG2	YOL025W	1983 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	MPA43	YNL249C	1629 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	SKP1	YDR328C	585 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	YJR142W	YJR142W	1029 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	ADE1	YAR015W	921 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	ACS1	YAL054C	2142 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	HIS7	YBR248C	1659 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	CEF1	YMR213W	1773 nt		5.5	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	LDB19	YOR322C	2457 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	snR82	snR82	268 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	YDR476C	YDR476C	675 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	FCY22	YER060W-A	1593 nt		5.49	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	ARP3	YJR065C	1350 nt		5.47	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	NUP57	YGR119C	1626 nt		5.47	□□□□□ -1.53
VAR1	P02381	HRB1	YNL004W	1365 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	NTG1	YAL015C	1200 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CYB2	YML054C	1776 nt		5.46	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	HXT17	YNR072W	1695 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CTF8	YHR191C	402 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	NCA3	YJL116C	1014 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CCW12	YLR110C	402 nt		5.45	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YGL081W	YGL081W	963 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	MCH2	YKL221W	1422 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CDC3	YLR314C	1563 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	RDR1	YOR380W	1641 nt		5.44	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	EXG2	YDR261C	1689 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YEL020C	YEL020C	1683 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CDC7	YDL017W	1524 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	BDF2	YDL070W	1917 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	SUF3	tG(CCC)D	72 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	NMA2	YGR010W	1188 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	PIL1	YGR086C	1020 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	PAU21	YOR394W	495 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	PAU22	YPL282C	495 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	CBK1	YNL161W	2271 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	RBS1	YDL189W	1374 nt		5.42	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.1 ms