Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01755 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01755 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01755 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01755 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01755 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01755 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01755 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01755 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01755 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01755 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01755 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01755 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01755 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01755 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01755 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01755 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01755 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01755 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01755 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01755 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01755 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01755 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01755 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01755 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01755 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01755 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms